
GWAS 全基因组关联分析有哪些优点和缺点? - 知乎
引言 全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS)是遗传学领域研究复杂性状和疾病遗传基础的强大工具。传统GWAS主要依赖SNP芯片技术,而随着测序技术的飞速发展,全基因组 …
如何用小样本50甚至更低的样本数寻找与表型相关的SNP位点? - 知乎
以下疾病可以替换为性状 常规 GWAS 的步骤是测序、检验每个SNP位点与疾病的相关性。检验完成后,得到每个SNP位点与疾病关联显著性的 p 值,进行统计多重检验校正后,即得到一系列显著与疾 …
邓飞 - 知乎
6 days ago · 1,PGS分析流程介绍 第一步:搜集数据、整理数据 包括搜集GWAS的summary 结果 表型数据和基因型数据检测 (类似GS中的间接法,比如rrBLUP、Bayes系列方法,根据SNP效应值进行 …
GWAS与WGS的区别? - 知乎
GWAS与WGS的区别? WGS好理解就是全基因组的测序,每个碱基都测一下,GWAS就理解不好? GWAS是不是可以测一个或者多个SNP位点,然后在研究他与疾病的相关性? 求大神解… 显示全部 …
在gwas研究中如何寻找最显著的SNP值,然后再根据这个SNP位点筛选 …
最显著的SNP指的是P值最小的点,在GWAS研究中一般认为P<5*10-8的点是有显著关联的。 比较早的GWAS研究是直接把这些P<5*10-8拿出来作为易感位点,后来会进一步用conditional 分析去寻 …
孟德尔随机化—共定位分析—GWAS? - 知乎
在GWAS分析中,一般只针对一个性状进行关联分析,而在QTL分析中,往往可以同时对很多表型进行关联。 此时,我们检验的表型就是每一个基因-开放区域配对数据,因此,我们需要首先确定所有的配 …
GWAS系列 - 知乎
GWAS前沿文献分享(一)| LT-FH:整合病例对照信息和疾病家族史的易感性阈值模型可进一步提高关联分析的功效 2020年5月,Nature Genetics杂志发表了题为“Liability threshold modeling of …
生物信息学全基因组测序GWAS 如何用小样本50甚至更低的样本数寻找 …
个人观点,样本量太少了,50个样本GWAS大概率是找不到什么有效信号的(除非是那些影响特别强烈的主效位点,当然,这种一般早就被研究过了;或者如果你的数据很稀有珍贵当然也可以)。
该怎样去学习GWAS? - 知乎
该怎样去学习GWAS? 现在在看关于植物耐寒性的论文,文中有提到GWAS,但是看不懂,对里面的一些专业名词不是很理解,想知道,要是想学好GWAS应该怎样做 关注者 23 被浏览
如何通过snp位点找到候选基因? - 知乎
如何通过snp位点找到候选基因? 实验室前期取样送公司做了GWAS测序,发现了一些比较好的SNP位点,现在想从这些snp位点找到一些抗逆相关的候选基因,求各位大佬有什么方法,可以简便的… 显示 …