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  1. 什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎

    ATAC思路: 通过Tn5转座酶(在染色质开放区域各种切割,形成复合物后插入到靶序列)来富集开放染色质的DNA序列,PCR扩增后NGS测序。 官方一点的话:DNA转座,是一种把DNA序 …

  2. 什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎

    康测科技为本研究提供ATAC-seq和LncRNA-seq技术服务。 通过对20对前列腺癌和邻近正常前列腺组织进行ATAC-seq来分析前列腺肿瘤发生中的染色质可及性变化。

  3. atac-seq和chip-seq的区别? - 知乎

    ATAC-seq 分析流程 (from Novogene) 与其他常用技术的比较: ChIP-seq:直接检测与转录因子结合的DNA序列,但 一次测序只能提供一个转录因子的信息,检出率相对较低。 DNase …

  4. 分析单细胞atac数据比较全面的工具是只有archar和signac麽? - 知乎

    Jan 12, 2023 · 引言 在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。 加载包 首先加载 Signac、Seurat 和我们将用于分析 …

  5. 这种热图怎么看啊,求大神们解惑? - 知乎

    就是不同条件下,相关修饰和染色质开放程度 (atac-seq)的水平比较。 每一个柱子 (不知道是不是恰当)的一条横线表示一个基因,中间表示TSS,颜色表示read映射到该位置的强度。

  6. ATAC 或 chip-seq中peak 图,下方基因位置中方框、箭头代表什么 …

    Oct 24, 2022 · ATAC-Seq是一种新型的研究开放染色质的技术,利用Tn5转座酶进入并切割裸露的DNA,并同时连接上特异性的测序接头。 因为切割和加接头一步完成,因此该技术可大大降 …

  7. ATAC-seq质量分析该如何分析,给出的fragment图与标准图相比明 …

    ATAC-seq技术的发展得益于Tn5转座酶的研究,Tn5转座酶的应用,大大简化了开放染色质研究的时间,从最初2-3天的实验周期,缩短到2-3小时【5】。

  8. scATAC-seq分析,没有fragememts文件该咋办? - 知乎

    求助各位大佬,最近在尝试学signac包单细胞ATAC分析,但是拿到的数据只有计数矩阵csv文件,没有fragements文件,这种情况该怎么办?

  9. scRNA-seq和snRNA-seq有什么区别? - 知乎

    一句代码就可以解决,而通过阅读其它相关的snRNA-seq文献,我们这里的QC稍微放宽一点也是没有什么问题的,就是说如果我们单纯拿scRNA-seq的质控流程来说应该也是没有问题的,因 …

  10. 增强子对应的基因去哪里找到? - 知乎

    增强子 是长度约200 bp非编码DNA序列,通过结合转录因子(Transcription factor)和辅助因子(Mediator)作用于对应的启动子上,增强基因表达的效率。与启动子相比,增强子调控基因 …